La Mesa Interinstitucional está integrada por la gobernadora provincial, Ana María Castillo; el director ejecutivo del Plan San Juan, Carlos Roa; el director regional Oeste de Agricultura, Juan Bourdierd; así como por los directores regionales de Educación y Medio Ambiente, Pablo Espinosa y Juan Francisco de la Rosa, respectivamente. Asimismo, integran la estructura técnica el Instituto Nacional de Bienestar Estudiantil (INABIE) y la Gerencia Regional de Salud El Valle.
El proyecto cuenta con el acompañamiento estratégico de la Agencia de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO), el Programa Mundial de Alimentos (PMA), el Programa de las Naciones Unidas para el Medio Ambiente (PNUMA) y la Secretaría Técnica para la Soberanía y Seguridad Alimentaria y Nutricional (SETEC-SSAN).
El modelo territorial propuesto persigue articular la producción agropecuaria local con las cadenas de suministro escolar y la restauración de los ecosistemas, centrándose en tres metas clave:
1. Transformación Sostenible del Sistema Alimentario: Fortalecer las capacidades institucionales para formular políticas públicas con enfoque sistémico y de sostenibilidad.
2. Seguridad Alimentaria Escolar y Salud: Establecer metodologías de «Escuelas Saludables y Sostenibles» que beneficien directamente a la comunidad educativa y a las familias de los estudiantes.

